ストーリー

コズミックイラ70･･･。
『血のバレンタインの悲劇』によって地球・プラント間の緊張は、
一気に本格的武力衝突へと発展した。
誰もが疑わなかった、数で勝る地球軍の勝利･･･。
が、当初の予想は大きく裏切られ、
戦局は疲弊したまま、すでに11ヶ月が過ぎようとしていた･･･。

そんなさなか、L5に浮かぶ中立国オーブの資源衛星ヘリオポリスにザフト軍が侵入、
連合初のMS『ガンダム』の奪取作戦が敢行された。
ザフト軍の完全な奇襲により、混乱に陥るヘリオポリス。
秘密裏に建造されていたガンダムは5機のうち4機までがザフト軍に手に落ちてしまう。
避難場所を探していた学生キラ・ヤマトは工場区画に迷い込み、
そこで偶然に残っていた1機のガンダムを目撃する。
ザフト兵の襲撃を逃れるため、やみなくストライクガンダムに乗り込むことになってしまったキラ。
そして、運命の歯車が動き出す･･･。